知識產(chǎn)權(quán)海關(guān)保護(hù)備案，是指知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人，按照《知識產(chǎn)權(quán)海關(guān)保護(hù)條例》的規(guī)定，將其知識產(chǎn)權(quán)的法律狀況、有關(guān)貨物的情況、知識產(chǎn)權(quán)合法使用情況和侵權(quán)貨物進(jìn)出口情況以書面形式通知海關(guān)總署，以便海關(guān)在對進(jìn)出口貨物的監(jiān)管過程中能夠主動對有關(guān)知識產(chǎn)權(quán)實(shí)施保護(hù)。 
根據(jù)1995年頒布的《知識產(chǎn)權(quán)海關(guān)保護(hù)條例》，知識產(chǎn)權(quán)備案是知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人向海關(guān)尋求保護(hù)的前提條件。2003年12月修訂的《知識產(chǎn)權(quán)海關(guān)保護(hù)條例》對此進(jìn)行了修改，不再要求知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人在向海關(guān)申請保護(hù)前必須進(jìn)行知識產(chǎn)權(quán)備案。但是，考慮到海關(guān)在依職權(quán)保護(hù)知識產(chǎn)權(quán)時，需要有足夠的信息保障，修訂后的《條例》仍然規(guī)定，知識產(chǎn)權(quán)備案是海關(guān)依職權(quán)保護(hù)的前提條件。
雖然事先不進(jìn)行知識產(chǎn)權(quán)備案，知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人仍然可以向口岸海關(guān)申請扣留侵權(quán)嫌疑貨物。但是，備案與否在實(shí)踐中還是有一定的的差異。事先進(jìn)行知識產(chǎn)權(quán)的意義主要體現(xiàn)在：
   （一）是海關(guān)主動保護(hù)的前提條件。根據(jù)《條例》的規(guī)定，知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人如果事先沒有將其知識產(chǎn)權(quán)向海關(guān)備案，海關(guān)發(fā)現(xiàn)侵權(quán)貨物即將進(jìn)出境，也沒有權(quán)力主動中止其進(jìn)出口，也無權(quán)對侵權(quán)貨物進(jìn)行調(diào)查處理。這一點(diǎn)對商標(biāo)權(quán)和著作權(quán)的保護(hù)方面特別重要；
   （二）有助于海關(guān)發(fā)現(xiàn)侵權(quán)貨物。盡管根據(jù)《條例》的規(guī)定，知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人在進(jìn)行備案后，仍然需要在發(fā)現(xiàn)侵權(quán)貨物即將進(jìn)出境時向有關(guān)海關(guān)提出采取保護(hù)措施的申請，但是，從實(shí)踐看，海關(guān)能否發(fā)現(xiàn)侵權(quán)貨物，主要依賴于海關(guān)對有關(guān)貨物的查驗(yàn)。由于知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人在備案時，需要提供有關(guān)知識產(chǎn)權(quán)的法律狀況、權(quán)利人的聯(lián)系方式、合法使用知識產(chǎn)權(quán)情況、侵權(quán)嫌疑貨物情況、有關(guān)圖片和照片等情況，使海關(guān)有可能在日常監(jiān)管過程中發(fā)現(xiàn)侵權(quán)嫌疑貨物并主動予以扣留。所以，事先進(jìn)行知識產(chǎn)權(quán)備案，可以使權(quán)利人的合法權(quán)益得到及時的保護(hù)；
   （三）知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)較輕。根據(jù)海關(guān)總署有關(guān)《知識產(chǎn)權(quán)海關(guān)保護(hù)條例》的實(shí)施辦法規(guī)定，在海關(guān)依職權(quán)保護(hù)模式下，知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人向海關(guān)提供的擔(dān)保最高不超過人民幣10萬元。如果知識產(chǎn)權(quán)權(quán)利人事先未進(jìn)行知識產(chǎn)權(quán)備案，則不能享受上述待遇，必須提供與其要求扣留的貨物等值的擔(dān)保；
    （四）可以對侵權(quán)人產(chǎn)生震懾作用。由于海關(guān)對進(jìn)出口侵權(quán)貨物予以沒收并給予進(jìn)出口企業(yè)行政處罰，盡早進(jìn)行知識產(chǎn)權(quán)備案，可以對那些過去毫無顧忌地進(jìn)出口侵權(quán)貨物的企業(yè)產(chǎn)生警告和震懾作用，促使其自覺地尊重有關(guān)知識產(chǎn)權(quán)。此外，有些并非惡意出口侵權(quán)產(chǎn)品的企業(yè)也可能通過查詢備案，了解其承攬加工和出口的貨物是否可能構(gòu)成侵權(quán)。